è un discorso lungo e complesso...
ma sicuramente è meglio ripristinare l'ultimo punto di ripristino in forma manuale... andando a correggere solo il file che si è eventualmente corrotto... quello della cartella repair è un registro molto striminzito e relativo solo al sistema appena installato.
Se ad esempio hai fatto un utente successivamente all'installazione, non te lo ritroverai installando il registro contenuto in repair... il che vuol dire che difficilmente riuscirai ad avere accesso ai tuoi dati (e soprattutto al tuo desktop)... e di fatto non riuscirai più a tornare al tuo sistema funzionante...
Al limite avrai solo accesso ai dati... e converrebbe quindo molto di più fare un semplice backup collegando l'harddisk ad un altro pc...