se la tua scheda grafica S3 era in formato agp, avendo il pc solo uno slot agp non puoi fare nulla, non possonomaterialmente coesistere due schede agp sulla stessa macchina. La S3 Savage 4 poi nonnera dotata di codificatore Hardware per i DVD ma solo software, era una ottima scheda (migliore di quello che si credesse) ma non eccelsa quindi nella visione di dvd (molti faticavano).
Le schede migliori ancora oggi per vedere i DVD sono le ATI (le originali hanno anche il migliore software per i dvd sul mercato, a detta mia) e le Matrox.
La Geforce FX 5200 dovrebbe, ma il condizionale è d'obbligo, incorporare il chip per la decodifica hardware dei dvd ed essere quindi superiore alla Savage 4. Se l'uso con i DVD è elevato sarebbe stata preferibile una ATI che con i driver della serie catalyst ha raggiunto una buona affidabilità.
Per risolvere il tuo problema devi prima guardare sulla scatalo o nel manuale le caratteristiche della scheda, e vedere se la decodifica è hardware o software, nel caso sia hardware procedi come suggerito da Dado ad aggiornare i driversarebbe utile capire che OS hai e sapere se il DMA è attivo, se non è attivo è risolto il problema.